Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkpQ9JLV6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkpQ9JLV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms