Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col5a3Q9JLI2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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