Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Extl1Q9JKV7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Extl1Q9JKV7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms