Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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