Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Swt1Q9DBQ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms