Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znhit3Q9CQK1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms