Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim3Q99PE5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms