Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rnf17Q99MV7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms