Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlgn1Q99K10 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms