Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2E2Q96LR5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms