Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rnf144aQ925F3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf144aQ925F3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf144aQ925F3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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