Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9999Q8C5Y2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9999Q8C5Y2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms