Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms