Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC23A3Q6PIS1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC23A3Q6PIS1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC23A3Q6PIS1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC23A3Q6PIS1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms