Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbtb40Q6PCS8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb40Q6PCS8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb40Q6PCS8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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