Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC181Q5TID7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC181Q5TID7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms