Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme4Q5SSW2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psme4Q5SSW2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms