Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930567H17RikQ3V0K5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930567H17RikQ3V0K5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms