Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm6Q3UZD5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Prdm6Q3UZD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm6Q3UZD5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms