Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87499Q3UX49 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87499Q3UX49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms