Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf6Q3TWW8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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