Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIGQ13278 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIGQ13278 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIGQ13278 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIGQ13278 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIGQ13278 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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