Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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TRAF3Q13114 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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TRAF3Q13114 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF3Q13114 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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