Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 PHO5YBR093C 1404 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 EXO5YBR163W 1758 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 CHA4YLR098C 1947 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 PUG1YER185W 912 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 PET130YJL023C 1044 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 MRPL49YJL096W 486 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 LSM1YJL124C 519 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YMR084WYMR084W 789 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 RRG9YNL213C 645 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 DIB1YPR082C 432 nt3.17□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 REC8YPR007C 2043 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 SHQ1YIL104C 1524 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YDR149CYDR149C 708 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YFL065CYFL065C 309 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 PEX21YGR239C 867 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YLR225CYLR225C 1224 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YNR063WYNR063W 1824 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 CIN8YEL061C 3003 nt3.16□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 BAR1YIL015W 1764 nt3.15□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 SQS1YNL224C 2304 nt3.15□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 TOP1YOL006C 2310 nt3.15□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 XRN1YGL173C 4587 nt3.15□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 RPS14AYCR031C 414 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YDL242WYDL242W 354 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 PDS1YDR113C 1122 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YKE4YIL023C 1041 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YPR077CYPR077C 372 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YPK3YBR028C 1578 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 CMK1YFR014C 1341 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 KIN3YAR018C 1308 nt3.15□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SKN7YHR206W 1869 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 QRI7YDL104C 1224 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 ECO1YFR027W 846 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YGR219WYGR219W 342 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 RPS28BYLR264W 204 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 TCP1YDR212W 1680 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 MIG1YGL035C 1515 nt3.14□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 MSA1YOR066W 1890 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 GYP6YJL044C 1377 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 STP1YDR463W 1560 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YDL176WYDL176W 2127 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 BSC1YDL037C 987 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YHP1YDR451C 1062 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 RPL30YGL030W 318 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YIR014WYIR014W 729 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 AIM26YKL037W 357 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 USV1YPL230W 1176 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 HPA2YPR193C 471 nt3.13□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 HFD1YMR110C 1599 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 CHK1YBR274W 1584 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 ARP4YJL081C 1470 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 GRX3YDR098C 858 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 FRQ1YDR373W 573 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SPT3YDR392W 1014 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YJR111CYJR111C 852 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SKG1YKR100C 1068 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 CPR8YNR028W 927 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 UAF30YOR295W 687 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 VPS28YPL065W 729 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 RPS11BYBR048W 471 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YBR096WYBR096W 693 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 PRP22YER013W 3438 nt3.12□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 PFK26YIL107C 2484 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 ENA5YDR038C 3276 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 ENA2YDR039C 3276 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 ENA1YDR040C 3276 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 MSS2YDL107W 1056 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 RRP17YDR412W 708 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 CAB2YIL083C 1098 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 BUR2YLR226W 1188 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 OST6YML019W 999 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 MRPL51YPR100W 423 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 CCM1YGR150C 2595 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 PAF1YBR279W 1338 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YAK1YJL141C 2424 nt3.11□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YHR202WYHR202W 1809 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YGR149WYGR149W 1299 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 IMP4YNL075W 873 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YDR089WYDR089W 2610 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YPR148CYPR148C 1308 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SUP45YBR143C 1314 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 CLG1YGL215W 1359 nt3.1□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 MGR3YMR115W 1506 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SDS23YGL056C 1584 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 FMP32YFL046W 624 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YGR026WYGR026W 837 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 RPS7AYOR096W 573 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 SAS5YOR213C 747 nt3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.8 ms