Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf9Q07105 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms