Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah2Q06986 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah2Q06986 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms