Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
rp9P97762 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
rp9P97762 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
rp9P97762 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
rp9P97762 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
rp9P97762 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
rp9P97762 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
rp9P97762 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
rp9P97762 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
rp9P97762 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
rp9P97762 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
rp9P97762 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms