Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTP1P59025 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTP1P59025 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTP1P59025 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTP1P59025 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP1P59025 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP1P59025 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP1P59025 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP1P59025 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP1P59025 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms