Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgd1P52734 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms