Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CratP47934 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CratP47934 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CratP47934 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CratP47934 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CratP47934 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CratP47934 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CratP47934 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CratP47934 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CratP47934 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CratP47934 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CratP47934 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CratP47934 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CratP47934 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CratP47934 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms