Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd4P46935 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd4P46935 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms