Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB4P28070 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB4P28070 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms