Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 TAPT1-212ENST00000510868 709 ntTSL 59.47□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 TAPT1-215ENST00000513359 749 ntTSL 59.21□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 TAPT1-205ENST00000505152 740 ntTSL 55.9□□□□□ -1.463e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.552e-21■■■■■ 28
U2AF2P26368 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.562e-21■■■■■ 28
U2AF2P26368 ERGIC2-206ENST00000548909 645 ntTSL 53.37□□□□□ -1.872e-21■■■■■ 28
U2AF2P26368 ERGIC2-207ENST00000549182 565 ntTSL 53.07□□□□□ -1.922e-21■■■■■ 28
U2AF2P26368 ERGIC2-209ENST00000551467 765 ntTSL 52.51□□□□□ -2.012e-21■■■■■ 28
U2AF2P26368 OSBPL9-212ENST00000484890 640 ntTSL 31.65□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 36.42□□□□□ -1.381e-20■■■■■ 28
U2AF2P26368 ATXN2L-216ENST00000564656 552 ntTSL 416.87■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 28
U2AF2P26368 TBCD-215ENST00000574818 771 ntTSL 311.71□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 28
U2AF2P26368 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.078e-34■■■■■ 28
U2AF2P26368 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.568e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 RSBN1L-204ENST00000445512 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.12□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 NFKBIZ-206ENST00000477601 548 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-15■■■■■ 28
U2AF2P26368 NFKBIZ-210ENST00000495089 877 ntTSL 26.56□□□□□ -1.361e-15■■■■■ 28
U2AF2P26368 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 228.25■■■□□ 2.112e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 226.32■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)25.53■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 AL133410.1-202ENST00000431981 472 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-206ENST00000587875 630 ntTSL 218.68■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-208ENST00000588297 580 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 213.15□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 513.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 525.59■■□□□ 1.697e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 525.5■■□□□ 1.677e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.327e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.97e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 219.34■□□□□ 0.697e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.647e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-207ENST00000579053 1313 ntTSL 515.25■□□□□ 0.037e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.057e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-208ENST00000580605 699 ntTSL 314.37□□□□□ -0.117e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 514.05□□□□□ -0.167e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 211.42□□□□□ -0.587e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 ENOSF1-217ENST00000584259 6340 ntTSL 211.2□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NUP98-214ENST00000527104 705 ntTSL 38.15□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.821e-10■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.637e-20■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.587e-20■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.367e-20■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-220ENST00000587881 1984 ntTSL 516.61■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 AP002495.1-203ENST00000528560 659 ntTSL 58.62□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 AP002495.1-201ENST00000532852 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.25□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 TMEM39A-211ENST00000491685 852 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 PIAS2-202ENST00000398654 2043 ntTSL 1 (best)29.1■■■□□ 2.254e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 27.9
U2AF2P26368 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.357e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 221.03■□□□□ 0.967e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.927e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.857e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-211ENST00000595357 1602 ntTSL 218.75■□□□□ 0.597e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-221ENST00000601631 1125 ntTSL 218.75■□□□□ 0.597e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-207ENST00000594357 850 ntTSL 518.75■□□□□ 0.597e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-218ENST00000600358 1267 ntTSL 518.75■□□□□ 0.597e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-216ENST00000598074 448 ntTSL 415.68■□□□□ 0.17e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STRN4-206ENST00000594287 951 ntTSL 514.2□□□□□ -0.147e-12■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-205ENST00000527763 1728 ntTSL 231.77■■■□□ 2.682e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-210ENST00000530688 1623 ntTSL 226.01■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-208ENST00000528694 2440 ntTSL 225.29■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CRACR2B-203ENST00000526531 714 ntTSL 320.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.099e-9■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 443.4 ms