Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1aP25118 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf1aP25118 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.6 ms