Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FlgP11088 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FlgP11088 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FlgP11088 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FlgP11088 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FlgP11088 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FlgP11088 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FlgP11088 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FlgP11088 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FlgP11088 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FlgP11088 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FlgP11088 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FlgP11088 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FlgP11088 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FlgP11088 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms