Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB6O95452 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB6O95452 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB6O95452 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB6O95452 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB6O95452 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB6O95452 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms