Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQL4O94761 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQL4O94761 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms