Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx8O88983 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx8O88983 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx8O88983 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx8O88983 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx8O88983 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms