Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp4O70480 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp4O70480 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms