Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 KATNB1-210ENST00000569627 622 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TRIOBP-202ENST00000344404 7300 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TTC3-208ENST00000428693 999 ntTSL 513.47□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-220ENST00000531532 554 ntTSL 413.2□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 313.19□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-219ENST00000530840 531 ntTSL 513.16□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 413.16□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 513.16□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 413.16□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 C14orf159-202ENST00000298858 642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 513.1□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 213.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 412.76□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 312.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 512.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GNA12-207ENST00000491117 3375 ntTSL 312.04□□□□□ -0.482e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 311.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 511.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 311.67□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ACVR1-210ENST00000539637 564 ntTSL 411.57□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 311.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 311.05□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 310.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.47□□□□□ -0.732e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TTC3-216ENST00000479930 8998 ntTSL 1 (best)9.92□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FAR2P4-201ENST00000416266 2210 ntTSL 29.91□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ACVR1-208ENST00000440523 534 ntTSL 39.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-204ENST00000525811 539 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 49.02□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.982e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 MYO1B-215ENST00000634375 567 ntTSL 48.73□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.032e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 EIF2AK4-204ENST00000558743 581 ntTSL 28.55□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 27.52□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EIF2AK4-202ENST00000558557 2449 ntTSL 27.51□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-206ENST00000415511 604 ntTSL 37.17□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 46.83□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 46.83□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ACVR1-205ENST00000413751 536 ntTSL 46.67□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 56.66□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 56.44□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 EIF2AK4-203ENST00000558629 4374 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.712e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 GLS-208ENST00000457316 821 ntTSL 44.22□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GLS-206ENST00000412247 693 ntTSL 34.01□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 LINC01344-203ENST00000608183 2631 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 30
DKC1O60832 BTBD11-203ENST00000415943 723 ntTSL 521.69■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 BTBD11-207ENST00000550706 667 ntTSL 520.69■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 513.66□□□□□ -0.222e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.722e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 510.39□□□□□ -0.752e-34■■■■■ 30
DKC1O60832 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.512e-34■■■■■ 30
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