Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN3O00409 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN3O00409 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms