Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20425E9Q035 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms