Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms