Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp42B2RQC2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms