Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn7aB1AYL1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scn7aB1AYL1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn7aB1AYL1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms