Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRIQ3A6PVS8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ3A6PVS8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms