Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01549A6NIU2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms