Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc27A2A6Q5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms