Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Knop1Q9Z2Q2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms