Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pf4Q9Z126 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms